Il primo edificio sacro del nucleo suburbano più antico della città di Bolzano è ancora accessibile. Anche se si tratta di un vero gioiello artistico e culturale, la piccola Chiesa di S. Giovanni in Villa, una delle chiese più antiche del capoluogo altoatesino, è poco nota. Oggi si nasconde tra le case in Vicolo San Giovanni. Consacrata nel 1180 dal vescovo Salomone di Trento, l'edificio romanico fu completato nel XIV secolo con una volta a botte e con la torre campanaria. La sacrestia risale invece al XVII secolo, periodo nel quale vennero aggiunte anche le aperture per le finestre e il portale.

Di assoluto pregio gli affreschi all'interno della chiesa. Il ciclo presbiteriale venne realizzato negli anni 1330 - 1335, mentre al 1365 risalgono gli affreschi nella volta a botte (Cristo come giudice nella mandorla) e sulle pareti laterali della navata (leggende di San Giovanni evangelista e di San Giovanni Battista). Essi vengono attribuiti agli artisti chiamati "Primo e Secondo Maestro di San Giovanni in Villa", fortemente influenzati dall'opera del padovano Guariento. In questi capolavori artistici si fondono le tradizioni nordiche con gli influssi della scuola giottesca.